El Museo de Ciencias Naturales se fundó en 1963 y en el se guardan restos fósiles hallados en el Parque Provincial Ischigualasto y exhibe una valiosa colección de minerales y rocas y se halla ubicado en el edificio que pertenecía a la antigua estación del FF.CC. Belgrano. El museo cuenta con seis salas y un hall central y tiene como propuesta es mostrar de la forma más didáctica posible el valor geológico y paleontológico del Parque Ischigualasto.
Actualmente está en preparación el Museo del Desierto. En su itinerario se puede observar el laboratorio de preparación el cual posee , grandes ventanales a través de los cuales puede apreciarse el trabajo que el personal del museo realiza con los fósiles. Dos salas del museo están destinadas a la exposición de minerales y rocas de San Juan, como la calcita |
