O capital da província tem o mesmo. Foi fundado em 1562 por Juan Jufré y Montesa. Em 1593, o filho dele. Luis Jufre y Meneses se mudou a cidade 3 km para o sul, porque tinha sido destruído por uma inundação do Rio de San Juan. Depois, em 1944, um tremor, 7.8 graus no Mercalli Scale, destruiu quase completamente isto. A cidade nova é caracterizada por suas ruas largas e quadrados cheio de árvores. Sua catedral mantém os restos de Frade a Justo Santa Maria de Oro, um dos participantes da História de Argentina, principalmente durante a assembléia de 1816. Domingo Faustino Sarmiento, outros dos líderes do país, nasceu aqui. A casa dele buscou reconstruída um tremor. O monastério de São Domingo sobreviveu isto, a cela que o San Martin ficou enquanto ele estava na cidade, restos como estava em 1815.

Os primeiros enredos foram concedidos às famílias Jufre, Ronquillo, Cardoso, Garcia Hernandez, Delvira e Melodias., o Lemos y Payo. São john o batista foi designado o padroeiro. Da fundação de San Juan, as pessoas tiveram que lutar contra as pessoas nativas. os sócios da Companhia de Jesus e a Congregação de São Domingo, tentados minorar os abusos. Em 1632, a rebelião índia do noroeste do país, manteve a cidade à distância para sobre um ano. Em 1633, dezessete aborígines eram hanged no Quadrado Principal da cidade. No dia junho 6 Th., 1751, o mestre principal, o Don Juan de Echegaray fundou a cidade de Jachal. Dois anos depois, Mogna foi fundado e; em 1788, as aldeias mais cedo uniram para fundar o San Agustin presente do Valle Fertil.